※主＝主題，Ａ，Ｂ，Ｃ，Ｄ＝応答，反＝反行
※表中，同じマス目の楽器は同じ動きをする
※フーガにおける各楽器の登場順序は，変奏曲の演奏順と同じである．フーガには各楽器の出現箇所に練習番号が割り振られている．したがって，この番号は変奏曲の番号と一致する．ただし，ピッコロは例外．
一度，出現したパートは，演奏し続けるというところが興味深い．
フーガ主題はパーセルの主題の中間部の変形である．応答ＡからＣはパーセルの主題から派生している．応答Ｄはパーセルの主題の低音旋律から派生している．
主題はアルペジョの連続であり，和音が基本的に一音ずつ下がっていく．しかし，チェロとトロンボーンの呈示だけは，一音ずつ上昇している．これを表中，「主反」と記した．この呈示の際の応答は，反行形をなしている．
主題の調性は長調であるが，ハープの呈示のみ短調である．
| 練習番号 | 主音 | ピッコロ | フルート | オーボエ | クラリネット | バスーン | 第１バイオリン | 第２バイオリン | ビオラ | チェロ | コントラバス | ハープ | ホルン | トランペット | トロンボーン | チューバ | 打楽器 | ||
| Fis | 主 | ||||||||||||||||||
| Ａ | H | Ａ | 主 | ||||||||||||||||
| Ｂ | E | Ｂ１ | Ａ | 主 | |||||||||||||||
| Ｃ | A | Ｂ２ | Ｂ１ | Ａ | 主 | ||||||||||||||
| Ｄ | D | Ｃ | Ｂ２ | Ｂ１ | Ａ | 主 | |||||||||||||
| Ｅ | A | Ａ | Ａ反 | 主 | 主 | ||||||||||||||
| Ｆ | C | Ｄ | Ｄ反 | Ａ | Ａ | 主 | |||||||||||||
| Ｇ | F | Ｄ反 | Ｄ | Ｂ１反 | Ｂ２反 | Ａ反 | 主反 | ||||||||||||
| Ｈ | E | Ｃ | Ｃ２ | Ｂ１ | Ｂ２反 | Ａ | 主 | ||||||||||||
| Ｉ | a | Ｂ３→Ａ | Ｂ３→Ａ | Ｂ３→Ａ | Ｂ３→Ａ | Ｂ３→Ａ | Ｄ→Ｂ３ | 主 | |||||||||||
| Ｊ | F | Ａ | Ｃ | Ｃ２ | Ｂ１ | Ｂ２ | Ｃ３ | 主 | |||||||||||
| Ｋ | H | Ｂ→Ａ２ | Ｂ２ | Ｂ１ | Ｂ２ | Ｂ１ | Ｃ→Ｂ→Ａ２ | Ｃ２ | Ｃ | Ｃ３ | Ａ | 主 | |||||||
| Ｌ | Es | Ｃ反 | Ｂ３ | Ｂ | Ｄ反 | Ｄ反 | Ｂ１ | Ａ反 | 主反 | ||||||||||
| Ｍ | H | Ａ | Ａ反 | Ａ | Ａ反 | Ａ | Ｃ | Ｃ | Ｃ | Ｃ | 主 | ||||||||
| Reharsal number |
key | picc | fl | ob | cl | bsn | vln I | vln II | vla | vlc | db | harp | hn | tpt | trbn | tuba | perc | ||
| Fis | subj | ||||||||||||||||||
| A | H | cntA | subj | ||||||||||||||||
| B | E | cntB1 | cntA | subj | |||||||||||||||
| C | A | cntB2 | cntB1 | cntA | subj | ||||||||||||||
| D | D | cntC | cntB2 | cntB1 | cntA | subj | |||||||||||||
| E | A | cntA | cntA inv |
subj | subj | ||||||||||||||
| F | C | cntD | cntD inv |
cntA | cntA | subj | |||||||||||||
| G | F | cntD inv |
cntD | cntB1 inv |
cntB2 inv |
cntA inv |
subj asc |
||||||||||||
| H | E | cntC | cntC2 | cntB1 | cntB2 inv |
cntA | subj | ||||||||||||
| I | a | cntB3 →cntA |
cntB3 →cntA |
cntB3 →cntA |
cntB3 →cntA |
cntB3 →cntA |
cntD →cntB3 |
subj | |||||||||||
| J | F | cntA | cntC | cntC2 | cntB1 | cntB2 | cntC3 | subj | |||||||||||
| K | H | cntB →cntA2 |
cntB2 | cntB1 | cntB2 | cntB1 | cntC →cntB →cntA2 |
cntC2 | cntC | cntC3 | cntA | subj | |||||||
| L | Es | cntC inv |
cntB3 | cntB | cntD inv |
cntD inv |
cntB1 | cntA inv |
subj asc |
||||||||||
| M | H | cntA | cntA inv |
cntA | cntA inv |
cntA | cntC | cntC | cntC | cntC | subj | ||||||||
金管楽器はフーガ主題を複数パートで分担している．例えば，ホルンの場合，各ホルンは主題の一部しか吹かない．すなわち，一本のホルンが主題全体を吹くことはない．四つのパートを組み合わせることによって，主題が完全に形作られる．トランペット，トロンボーンおよびチューバも同様．
＜打楽器の楽器分配＞
打楽器は，次のように分けられる．
| 演奏楽句 | 担当楽器 | ||
| 主題全体 | タンバリン，小太鼓 | ||
| 主題の一部 | ティンパニ | シンバル | 木琴，大太鼓 |
| ※ティンパニ，シンバル，木琴は排他的．すなわち，このうちのある楽器が演奏しているとき，他の楽器は休み．三つの楽器を合わせて，はじめて主題が形成される．大太鼓は，木琴の下のＨの音と同期している． | |||
